África

Natureza (2023)Cite este artigo

273 Altmétrico

Detalhes das métricas

O VIH-1 continua a ser uma crise de saúde global1, realçando a necessidade de identificar novos alvos para terapias. Aqui, dada a carga desproporcional do VIH-1 e a acentuada diversidade do genoma humano em África2, avaliámos os determinantes genéticos do controlo do ponto de referência da carga viral em 3.879 pessoas de ascendência africana que vivem com o VIH-1, participando na colaboração internacional para a genómica do VIH-1. VIH3. Identificamos um sinal de associação anteriormente não descrito no cromossomo 1, onde a variante de pico se associa a aproximadamente 0,3 cópias transformadas em log10 por ml de carga viral de ponto de ajuste inferior por cópia de alelo menor e é específica para populações de ascendência africana. A variante principal associada é intergênica e situa-se entre um longo RNA não codificante intergênico (LINC00624) e o gene codificador CHD1L, que codifica uma helicase que está envolvida no reparo do DNA4. Ensaios de infecção em macrófagos derivados de células iPS e outras linhas celulares imortalizadas mostraram aumento da replicação do HIV-1 em células knockdown de CHD1L e células knockout de CHD1L. Fornecemos evidências de estudos genéticos populacionais de que a variação genética específica da África próxima ao CHD1L se associa à replicação do HIV in vivo. Embora estudos experimentais sugiram que o CHD1L é capaz de limitar a infecção pelo VIH em alguns tipos de células in vitro, são necessárias investigações adicionais para compreender os mecanismos subjacentes às nossas observações, incluindo quaisquer potenciais efeitos indirectos do CHD1L na propagação do VIH in vivo que os nossos ensaios baseados em células não conseguem. recapitular.

Esta é uma prévia do conteúdo da assinatura, acesse através da sua instituição

Acesse a Nature e 54 outras revistas do Nature Portfolio

Obtenha Nature+, nossa assinatura de acesso on-line de melhor valor

$ 29,99 / 30 dias

cancelar a qualquer momento

Assine esta revista

Receba 51 edições impressas e acesso online

$ 199,00 por ano

apenas $ 3,90 por edição

Alugue ou compre este artigo

Os preços variam de acordo com o tipo de artigo

a partir de US$ 1,95

para US$ 39,95

Os preços podem estar sujeitos a impostos locais que são calculados durante a finalização da compra

O acesso aos dados de genotipagem a nível individual é restrito a investigadores de instituições que aderem à Colaboração Internacional para a Genómica do VIH (ICGH) através da assinatura do acordo de colaboração do ICGH, que pode ser obtido mediante pedido ([email protected]). Devido à natureza altamente sensível do diagnóstico do VIH de todos os participantes no estudo, o risco associado à potencial reidentificação foi considerado muito elevado pelos IRB, impedindo uma partilha mais ampla de dados a nível individual. As estatísticas resumidas do GWAS estão depositadas no Catálogo NHGRI-EBI de estudos de associação do genoma humano (//www.ebi.ac.uk/gwas/home) sob o número de acesso GCST90269914. Os dados de RNA-seq estão disponíveis no NCBI (PRJEB18581) e os resultados do eQTL estão disponíveis no GitHub (https://github.com/smontgomlab/AFGR).

Dados da ONUSIDA 2021 (ONUSIDA, 2021); https://www.unaids.org/en/resources/documents/2021/2021_unaids_data.

Gurdasani, D., Barroso, I., Zeggini, E. & Sandhu, MS Genômica do risco de doenças em populações globalmente diversas. Nat. Rev. 20, 520–535 (2019).

Artigo CAS PubMed Google Scholar

McLaren, PJ et al. Estudo de associação de variantes genéticas comuns e aquisição de HIV-1 em 6.300 casos infectados e 7.200 controles. PLoS Pathog. 9, e1003515 (2013).

Artigo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Ahel, D. et al. Regulação dependente de poli (ADP-ribose) do reparo do DNA pela enzima de remodelação da cromatina ALC1. Ciência 325, 1240–1243 (2009).

Artigo ADS CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Relatório sobre Lacunas na Prevenção (ONUSIDA, 2016).

Mellors, JW et al. A quantificação do RNA do HIV-1 no plasma prevê o resultado após a soroconversão. Ana. Estagiário. Med. 122, 573–579 (1995).